Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT10P13645 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT10P13645 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT10P13645 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT10P13645 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT10P13645 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT10P13645 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT10P13645 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT10P13645 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT10P13645 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT10P13645 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT10P13645 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT10P13645 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms