Protein–RNA interactions for Protein: P08253

MMP2, 72 kDa type IV collagenase, humanhuman

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP2P08253 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP2P08253 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP2P08253 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP2P08253 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP2P08253 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP2P08253 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP2P08253 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP2P08253 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP2P08253 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP2P08253 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP2P08253 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP2P08253 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP2P08253 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP2P08253 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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