Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNUPNO95149 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNUPNO95149 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNUPNO95149 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNUPNO95149 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNUPNO95149 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNUPNO95149 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms