Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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