Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms