Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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