Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms