Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms