Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

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Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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NPIPB13A6NJU9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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NPIPB13A6NJU9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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NPIPB13A6NJU9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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NPIPB13A6NJU9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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NPIPB13A6NJU9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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NPIPB13A6NJU9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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