Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms