Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms