Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms