Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH22Q9UJ99 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms