Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5BQ9UGL1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms