Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms