Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ORC3Q9UBD5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms