Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms