Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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