Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms