Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-5Q9HDB9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-5Q9HDB9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-5Q9HDB9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-5Q9HDB9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-5Q9HDB9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms