Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPJQ9HC77 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPJQ9HC77 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPJQ9HC77 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPJQ9HC77 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPJQ9HC77 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPJQ9HC77 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPJQ9HC77 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms