Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC3GQ9HC16 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms