Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDFQ9HBH1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDFQ9HBH1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms