Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRDE2Q9H7Z3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms