Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms