Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CNTNAP3Q9BZ76 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CNTNAP3Q9BZ76 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CNTNAP3Q9BZ76 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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