Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms