Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms