Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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