Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms