Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC106Q9BWC9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms