Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms