Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT8L2Q96SF2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms