Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms