Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms