Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms