Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-CQ95604 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms