Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms