Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ZNF548Q8NEK5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ZNF548Q8NEK5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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ZNF548Q8NEK5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ZNF548Q8NEK5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ZNF548Q8NEK5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ZNF548Q8NEK5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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