Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8DQ7L1W4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8DQ7L1W4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8DQ7L1W4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8DQ7L1W4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8DQ7L1W4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8DQ7L1W4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms