Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms