Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L3Q6VB84 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms