Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms