Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms