Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms