Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 KCTD21-AS1-201ENST00000500113 1789 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 UGT1A8-201ENST00000373450 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 FKBP1A-202ENST00000381719 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC098617.1-202ENST00000428980 1207 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MS4A6A-217ENST00000533023 780 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC087235.1-201ENST00000538297 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 LINC01511-202ENST00000504989 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 TXNL4B-201ENST00000268483 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms