Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCAF6Q58WW2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms