Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UVSSAQ2YD98 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms