Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms