Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms